En décembre 2015, les premiers cas évocateurs de Zika ont été identifiés en Martinique puis début janvier en Guadeloupe et en Guyane. La première quinzaine de mars 2016, près de 11 000 cas étaient cliniquement évocateurs en Martinique, 717 en Guadeloupe dont 77 ont été confirmés biologiquement (2 concernaient des femmes enceintes et  une forme neurologique) et plus de 1 800 cas évocateurs en Guyane dont 142 confirmés biologiquement. On parle donc d'épidémie établie en Martinique et en Guyane et de circulation virale active en Guadeloupe.