À côté du syndrome oral et de l'anaphylaxie, qui sont des manifestations gastro-intestinales de l'allergie alimentaire IgE-dépendantes, il existe des manifestations mixtes, IgE et non IgE dépendantes comme l'œsophagite à éosinophiles, et des syndromes gastro-intestinaux induits par les protéines alimentaires non IgE-dépendants, tel que le (SEIPA), la maladie cœliaque ou l'hypersensibilité au blé non cœliaque.