Si l'évolution est favorable, il est inutile d’effectuer un ECBU de contrôle systématique, ni sous traitement, ni à distance de la fin du traitement, l’ECBU est nécessaire en cas de persistance de la fièvre au-delà de 72 h malgré une antibiothérapie adaptée.

L’IU masculine aiguë peut-être le mode de révélation d’un trouble urinaire du bas appareil (hyperplasie bénigne de prostate, sténose urétrale) et, chez l’homme de plus de 50 ans, d’un cancer de la prostate, ce qui justifie un dosage du PSA à trois mois.